Para llevar a cabo las líneas estructurales de la Oficina se trabaja en cooperación y acciones conjuntas con instituciones especializadas. Algunas de estas organizaciones son el Consejo Internacional para las Iniciativas Ambientales Locales (ICLEI); la Fundación CLINTON; Energiaslimpias.org; la Fundación Bariloche; COPAARA, y del sector académico la Universidad Tecnológica Nacional y la Universidad de Buenos Aires.